在未来的世界中，感染了X病毒的邪恶一方将带着强大的红色盾牌出现在地球的每个角落。在短短七天内，地球上一半的领土被宣布沦陷。人们流离失所，躲在最后的保留地求生。国际科学技术局（ISO）的南博士（）发现一块神秘的石头可以给特定的人群带来强大的力量，而拥有增强力量的超级士兵是阻止邪恶一方的唯一人选。之后，秃鹫尾健（松坂东篱）、大月纯（刚力彩芽）、大月甚平（滨田龙臣）和中西龙（铃木良平）等人被ISO发现，经过许多常人难以想象的特殊训练，他们成长为对抗邪恶一方的科学忍者战士。一场战斗后，健的老朋友乔治朝仓（饰）加入了战斗，他们奉命保护逃跑的邪恶党领袖伊利亚（中村史多饰），以获取最后一次自杀计划的细节。面对这个死敌，简和乔治的内心正在悄然发生变化...